РНК-термометром называется консервативный 5’-нетранслируемый участок ряда бактериальных мРНК, транслируемых только в условиях теплового шока. Подобные мРНК кодируют шапероны и протеазы, поэтому тепловая индукция их трансляции позволяет бактерии адаптироваться к воздействию повышенной температуры и нивелировать последствия денатурации белков.
Недавние исследования структуры РНК-термометра с помощью ЯМР (S.Chowdhury et.al, EMBO J., 2006, 25, 2487-2497) позволили раскрыть механизм термочувствительной репрессии трансляции. Оказалось, что при 30⁰C РНК-термометр сворачивается в петлю, включая в нее последовательность Шайна-Дальгарно и инициаторный AUG-кодон. Таким образом инициация трансляции становится невозможной. При повышении температуры до 42⁰С петля денатурирует и становится доступной для взаимодейтсвия с 30S субъединицей рибосомы.


На рисунке изображена структура участка РНК-термометра и ее схематическое изменение при повышении температуры, приводящее к освобождению последовательности Шайна-Дальгарно и взаимодействию мРНК с субъединицей рибосомы (Б). Делеция консервативного G83, с которого начинается денатурация петли, приводит к стабилизации петли и конститутивной репрессии трансляции РНК-термометром (А). MicroROSE – фрагмент исследованного РНК-термометра (ROSE – repressor of heat-shock gene expression)