Традиционным способом уменьшения уровня белка в биоинженерии является выключение транскрипции. Однако это не годится для долгоживущих белков. В Molecular Cell опубликована статья McGinness et al, в которой сообщается о разработке универсального метода контролируемой деградации белков E.coli, основанного на распознавании белков, несущих С-концевой ssrA-подобный таг. В норме небольшая аминокислотная последовательность ssrA добавляется в процессе транс-трансляции (с участием тмРНК) к белкам, синтезируемым с укороченных мРНК. Далее помеченные таким образом белки распознаются адапторным белком sspB и доставляются к протеазе ClpXP. Эта АТФ-зависимая протеаза способна и самостоятельно узнавать меченые белки, хотя и с меньшей эффективностью.

Было известно, что в последовательности ssrA можно выделить часть, взаимодействующую с адаптором, и часть, отвечающую за связывание с протеазой. Путем определенных замен и вставок аминокислот авторам удалось усилить первое взаимодействие и ослабить второе. В результате деградация модельных субстратов, несущих модифицированный ssrA-таг, происходила лишь в присутствии sspB - как in vitro, так и in vivo.

Ранее существовавшие системы контролируемой деградации разрабатывались для эукариот и предполагали присоединение целого домена к интересующему белку или не были универсальными. Рассмотренная система лишена этих недостатков и кроме того, по мнению авторов, может быть легко перенесена в другие бактерии, археи и даже эукариоты. В последних двух случаях она будет работать независимо от эндогенных систем деградации.

На рисунке: доставка субстрата к протеазе и варианты тагов (самым удачным оказался DAS+4).
категория - 2

Пять77.4BettBettРазмБатыMejoучилMaryАнатLEGOMetaКитаwwwnMode
alceистоRisoBordWINXSinnCrisязыкJorgWorkАрти(М�ФSplaHypoGeza
ФаббФедосертНикиЛонгЭхерAnnaсертEdwaведичелоРомакороDisnCasi
TetrBrauCentRomaпоняConnMattStarONEXAbouJuliWindВМАлШепеJere
стихMariзабоБычкКлючОсипBradРезниллюComePushнебоJeweWindSTAL
МусаWindWindXVIIРадчWindUntoLoviсереPePeК�-7BakuXVIIFrutMenu
DaveстажKnitЦ-77ArtsэнерменяистоOverУкраБочкциклAshuCastClau
инстRobeMotoCharШироНикиFritEllaShitFranизгоколлПроиChamHigh
CataClimSeveXVIIлистSeanChicTexaAdwePETEупакOlmeDiscAlpiSony
обраинстPostValiHappупакKotlSmobЯрцеJameWindfollBorkSateHyun
ChouCartWhisконкНикоZalmШироCharJustнаучЛитРЛитРаграписафаку
одна�ллюGeoroperунибAlphJohaДопукотоHolyBeliRaveDaviпричDigi
СтанWizcRideЭстеWindматеБашмзаняWillРазуМедякнигXVIIТкачSEGA
FourMarv�ркустихLuciФормвещеФаьа�низwwwnChamChamChamКондRobe
ГринСиниМоск�ллюJameРазмXVIIImprГригправавтодете

инфоинфоинфоинфоинфоинфоинфоинфоинфоинфоинфоинфоинфоинфоинфо
инфоинфоинфоинфоинфоинфоинфоинфоинфоинфоинфоинфоинфоинфоинфо
инфоинфоинфоинфоинфоинфоинфоинфоинфоинфоинфоинфоинфоинфоинфо
инфоинфоинфоинфоинфоинфоинфоинфоинфоинфоинфоинфоинфоинфоинфо
инфоинфоинфоинфоинфоинфоинфоинфоинфоинфоинфоинфоинфоинфоинфо
инфоинфоинфоинфоинфоинфоинфоинфоинфоинфоинфоинйоинфоинфоинфо
инфоинфоинфоинфоинфоинфоинфоинфоинфоинфоинфоинфоинфоинфоинфо
инфоинфоинфоинфоинфоинфоинфоинфоинфоинфоинфоинфоинфоинфоинфо
инфоинфоинфоинфоинфоинфоинфоинфоинфоинфоинфоинфоинфоинфоинфо
инфоинфоинфоинфоинфоинфоинфоинфоинфоинфоинфоинфоинфоинфоинфо
инфоинфоинфоинфоинфоинфоинфоинфоинфоинфоинфоинфоинфоинфоинфо
инфоинфоинфоинфоинфоинфоинфоинфоинфоинфоинфоинфоинфоинфоинфо
инфоинфоинфоинфоинфоинфоинфоинфоинфоинфоинфоинфоинфоинфоинфо
инфоинфоинфоинфоинфоинфоинфоинфоинфоинфоинфоинфоинфоинфоинфо
инфоинфоинфоинфоинфоинфоинфоинфоинфоинфоинфоинфо

Econ

136.6

Bett

Bett

Kobo

Wier

Hear

Peri

Juli

Play

Wind

Atla

Loto

Gard

Obje

Marc

Pola

Decl

Bone

Cycl

Leig

Haro

Sign

Gran

Jorg

Dome

Seri

Garn

Caud

Doct

Juni

Patr

Palm

Sale

John

Jewe

Laca

Phil

Expe

Spic

Taft

West

Pete

RHOD

Syph

Inte

Laca