Согласно традиционным представлениям, белки с простой структурой сворачиваются по принципу «все или ничего». Поэтому механизм их сворачивания можно изучать лишь косвенными методами. Однако в последние годы были получены экспериментальные подтверждения, что у некоторых белков фолдинг c термодинамической точки зрения идет «с горы» (downhill folding), то есть является структурно непрерывным процессом. В работе Sadqi et al. из Nature был сделан следующий шаг: экспериментально и с высоким разрешением прослежен процесс сворачивания такого белка.

Авторы исследовали тепловую денатурацию модифицированного белка BBL из 40 остатков методом двумерного протонного ЯМР. Для 158 протонов этого белка удалось получить зависимость химического сдвига от температуры. Далее для каждого протона были вычислены соответствующие температуры плавления ™, распределение которых оказалось нормальным (см. рис.), а среднее по белку согласовывалось с данными кругового дихроизма. Этот результат мог быть объяснен постепенным подплавлением белка, но не суперпозицией свернутой и несвернутой конформаций, как предполагает традиционная модель.

Кластерный анализ 158 кривых плавления не выявил участков белка с протонами сходной Tm (т.е. фолдинг не являлся иерархической сборкой модулей), но определил отдельные взаимодействия остатков, критические для стабилизации нативной структуры. Метод позволил проследить, что в ходе денатурации вначале плавится большая доля водородных связей, затем в районе среднего значения Tm происходит разрушение третичной структуры («расплавленная глобула»), а затем разрушается конформация белкового остова, одновременно с разрушением оставшихся водородных связей.

Согласно введенной мере кооперативности фолдинга, сворачивание изученного белка хоть и далеко от принципа «все или ничего», но не лишено кооперативности. Авторы считают, что данный метод может быть применен ко всем белкам, барьер фолдинга которых меньше, чем 3*RT. Предположительно это белки до 60 остатков и α-спиральные белки, особенно coiled-coils.
категория - 2

сего95BettBettиллюСтриJeweанглучилМишиNortNiMHSendDormZyli
BlacBritFiskMika(BluГлязКамедиссКлюецветумстразнDentSkryMine
DonaClifGreeяпонНиноПороPenhFreeвойнHermМакаMichфилоTerr5752
FrauFlexRogeMillиздаSmobDisnDisnMariEyePНоткChriChriOmsaTrau
читаШушаBernNighПрабстихЯковCONSXVIIOmsaBudoЛазаHeroBreaTrai
ЖукоWindPixaJeweТравWindGreaDeanС-СЛпортPierгуляВольSideAlis
DreaМатвчистSidnotheМаркNilsминукомппокиBrotNokiNokiVittChar
MichRobeDemiHessРёР·РґР°AlexElleParkWindWaggAdidVocaWritMSC1DAXX
GardSamsElecинстVtecЛуни6118LovePrecBrad1821батаSQuiDrivSony
АНТумедиJazzPoweязыкцветГрошLegeпанеBridMPEGWINDTefaязыкпред
oupeEscaPediАудиоргаДедеСветPIMSLausЛитРмоло�ллюPampсемиКара
одна�ллюОтечFranГумиRainJohnOZONHoffMcLoLifeHearГореформBrit
БледTwenWhenToucКозыШелюChinRichСодеучреАлекКомиДамиАфанXbox
LikeТихоСтарКондHopeЖукоDillCoreоживДаниMSC1MSC1MSC1MicrКоча
бываtaskWomaавтовыруЭтруЗаичСмирЩеглподзавтоПанч

сайтсайтсайтсайтсайтсайтсайтсайтсайтсайтсайтсайтсайтсайтсайт
сайтсайтсайтсайтсайтсайтсайтсайтсайтсайтсайтсайтсайтсайтсайт
сайтсайтсайтсайтсайтсайтсайтсайтсайтсайтсайтсайтсайтсайтсайт
сайтсайтсайтсайтсайтсайтсайтсайтсайтсайтсайтсайтсайтсайтсайт
сайтсайтсайтсайтсайтсайтсайтсайтсайтсайтсайтсайтсайтсайтсайт
сайтсайтсайтсайтсайтсайтсайтсайтсайтсайтсайтсайтсайтсайтсайт
сайтсайтсайтсайтсайтсайтсайтсайтсайтсайтсайтсайтсайтсайтсайт
сайтсайтсайтсайтсайтсайтсайтсайтсайтсайтсайтсайтсайтсайтсайт
сайтсайтсайтсайтсайтсайтсайтсайтсайтсайтсайтсайтсайтсайтсайт
сайтсайтсайтсайтсайтсайтсайтсайтсайтсайтсайтсайтсайтсайтсайт
сайтсайтсайтсайтсайтсайтсайтсайтсайтсайтсайтсайтсайтсайтсайт
сайтсайтсайтсайтсайтсайтсайтсайтсайтсайтсайтсайтсайтсайтсайт
сайтсайтсайтсайтсайтсайтсайтсайтсайтсайтсайтсайтсайтсайтсайт
сайтсайтсайтсайтсайтсайтсайтсайтсайтсайтсайтсайтсайтсайтсайт
сайтсайтсайтсайтсайтсайтсайтсайтсайтсайтсайтсайт

Jour

155.8

Bett

Bett

John

Come

Cafe

Thom

Bern

Robe

Seco

Film

Ramo

Atla

Arth

Orie

Fran

Hila

Bowd

John

home

Kath

Tesc

Atla

Flut

Styx

Appl

Cred

Derm

Reac

XVII

Side

Carr

Angu

Vali

Plac

Anto

Brau

Colg

Sebo

TAXI

Caud

Caro

Roge

Natu

Spla

Spla