Дано: структуры белков А и Б (в файлах pdb).
Предстоит: сделать химерный белок А-линкер-Б.
Требуется: программа, в которой можно нарисовать эту составную структуру (с одной из возможных ненапряженных конформаций линкера).
Т.е.: полного молдинамического рассчета системы не нужно, главное простота использования.
Интересна возможность оценки гибкости пептида-линкера.

Modeller

Starless :
Дайте, пожалуйста, ссылку на разработчика программы или место скачивания.

гугл вам поможет, не ленитесь

Если бы помог, я бы не спрашивал.
Еще варианты.

Нет программ для этого лучше modeller.

И учитесь пользоваться поисковиком, полезно: http://www.google.ru/search?q=Modeller+Pro...lient=firefox-a
Запрос: Modeller Program

вторую букву "л" пропустил, бедолага - гугл он только грамотным помогает ну или настойчивым

Кстати, стоит иметь в виду, что построение молекулярной модели - совсем не такое простое нечто, как кажется со стороны.

Chlorum:
Вопрос и был в том, что нужен простой вариант (в ущерб достоверности, ессно).

Простых вариантов в вашем случае быть не может. Хоть у вас и известна структура доменов - их взаимное расположение не определено. И конформация линкера может играть в оном совершенно не первостепенную роль. Потому вам не предлагают воспользоваться услугами SwissProt. А предлагают Modeller. Заумнее, но достовернее. ам же не предлагают потом гнать все в тот же GROMACS...

Просто желание - хочу все просто, без усилий и сейчас - раздражает. Моделирование - оно почти искусство, а тут... =(

ну или в фотошопе линкер нарисуйте и дело с концом - степень достоверности примерно таже самая

Chlorum:
Отвечаете не на тот вопрос и переходите на личности.

Еще варианты.

Где это я, позвольте, перешел на личности *подивился* И где не на тот вопрос отвечаю? Вот именно такой подход и раздражает...

Вам же, кроме того сказали, хотите просто совсем вне зависимости от достоверности - вперед на SwissModel. Или в фотошоп.

Правильно, Chlorum! Полностью поддерживаю!