Подскажите, пожалуйста, как сравнить геномы двух микроорганизмов на предмет наличия (хотя бы количественного) гомологичных генов (полдня просидела в бласте- как найти гомологичные участки в геноме одной микробы -выяснила, как каждый отдельный ген проверить на предмет гомологичности к другой микробе- тоже выяснила, но должен же быть путь, как сделать это быстро между двумя геномами! ПЛИИИЗ!!!!

Спасибо, что посмотрели - уже разобралась...

Пишите скрипт или найдите того, кто захочет это сделать для Вас.

Сделайте MCL-clustering.

http://orthomcl.org/cgi-bin/OrthoMclWeb.cg...thomcl#Software

Народ часто пользует. Но если бактерии не сильно близкие, то все становится сложнее