Добрый день!
Нужна помощь - хочу попробовать сделать филогенетическое дерево членов одного семейства м.э. Правомерно ли рассчитывать на адекватный результат? Аналогичных работ не находил (все работы относятся к филогении между разными семействами). Кто-нибудь, кто занимается (занимался) в данной области- может что подскажете?
Спасибо!

А почему нет?

В зависимости от родства последовательностей используйте либо ДНК либо белки. Да и все.

Есть вот такой открытый проект http://ru.wikiversity.org/wiki/«Геном_прокариот»_(проект)

где среди прочего задачей является построить филогенетическое дерево ... присоединяйтесь ..

Лучше всего использовать тРНК для анализа - дает достаточно хорошие результаты, позволяет отследить конъюгацию у бактерий