Здравствуйте! Есть результат секвенирования некой последовательности - набор кусков кода, надо построить из всего этого контиг, найти ошибки, если надо перевернуть куски генома и тп.В связи с чем возник вопрос: есть ли (думаю что должны быть) готовые алгоритмы этого процесса для ЭВМ? Не хотелось бы самому изобретать велосипед...

Зависит от того что вы делаете, если вы отсеквенировали ген в 1200 оснований с двух сторон и хотите эти два куска совместить, то это одна история, в любой проге для анализа последовательностей такое есть. Sequencer, это то что в лабе где я работаю используют, Знаю что вектор популярен.

И совсем другое дело когда вы хотите большой геном из маленьких кусочков собрать...
Ищите sequence assembly в google.