Полная версия страницы  English  

не сохраняет в MEGA-формате {MEGA4.1}

Feodor, 14.05.2010 15:48
ПОмогите, кто знает-
закачал в мегу файл *.aln, подкорнал выступающие узлы, выровнял , хочу перейти к постройке дерева----> надо сохранить в MEGA -формате.
А прога выдаёт-
Error#4526- Invalid base found...

откуда? почему?
(прикреплён файл в *.fasta-)


Файл/ы:

скачать файл clustalw2_20100514_1243413446ALNALN_fasta.rar
размер: 1.18
кол-во скачиваний: 172


Feodor, 14.05.2010 18:26
всё, разобрался- цифры долбанные читаются
Pusya, 23.06.2010 16:58
Подскажите как вам это удалось. У меня таже проблема.
Pryanik, 24.06.2010 06:11
Как у вас этот файл вообще загрузиля с МЕГУ...

Народ, гугл знает все. Помните об этом. Вот например стреничка википедии на тему fasta format

http://en.wikipedia.org/wiki/FASTA_format

а вот конвертер со многими широко используемыми форматами:
http://www.ebi.ac.uk/cgi-bin/readseq.cgi

Кроме как класалом стоит пользоваться mafft и muscle, так же как и кластал они доступны через веб-сервер
http://www.ebi.ac.uk/Tools/mafft/
http://www.ebi.ac.uk/Tools/muscle/
Guest, 01.09.2010 23:25
(Pusya @ 23.06.2010 16:58)
Ссылка на исходное сообщение  Подскажите как вам это удалось. У меня таже проблема.


там в окне - где все последовательности визуализировались разными цветами, в местах гепов - стояли, кажется, какие-то дурные цифры (т.е. вместо буквы)- я их удалил дэлитом - и всё ок
вроде в том была проблема
Это — лёгкая версия форума. Чтобы попасть на полную, щелкните здесь.
Invision Power Board © 2001-2012 Invision Power Services, Inc.