Секвенирование генома обычно требует упорядочивания последовательнойстей ДНК из тысяч, если не из миллионов, клеток. Команда, которую возглавляет Чинганг Зонг, использовала метод, позволяющий исследователям секвенировать до 93 процентов генома из одной клетки. Данный метод поможет ученым идентифицировать специфические для клетки изменения последовательности ДНК, которые могли бы, к примеру, прояснить, как отдельные раковые клетки становятся более злокачественными или чем отличаются нейроны. Чтобы расшифровать геном одной клетки, исследователи применили процесс амплификации ДНК, названный MALBAC (multiple annealing and looping-based amplification cycles). Метод позволяет создавать вполне достаточное количество копий ДНК, необходимой для секвенирования, не сверхкопируя определенные области, которые легко копируются, что является критическим условием при секвенировании малых количеств ДНК. Особенностью метода является добавление ДНК-праймеров — небольших фрагментов ДНК, связыващихся с одноцепочечной ДНК и инициирующих процесс копирования — у которых есть дополнительная последовательность нуклеотидов. После того, как копируется фрагмент генома, дополнительные последовательности праймеров "склеиваются", формируя петлю, что препятствует многократному копированию одного и того же участка. Хотя метод и предполагает нейкий процент ошибок, исследователи считают, что он будет широко распространён. «Я думаю, люди начнут использовать его сразу же», - считает Джеймс Эбервайн, работающий с геномами отдельных клеток в Медицинской школе Перельмана в Университете Пенсильвании, не принимавший участия в исследовании.
Исследование было проведено на базе Департамента химии и биохимии Гарвардского университета, США.
Источники:
перевод