Полная версия страницы  English  

Геномика воссоздает историю миграций в Европе

Dashas, 27.05.2013 01:06
картинка: journal.pbio.1001556.g001.pngБольшинство из нас знает своих предков на пару поколений назад , не задумываясь о более глубоких «корнях» своей семьи. В то же время, почти все современные жители Европы 3-4 тыс. лет назад имели общих предков. Для того, чтобы прояснить родственные связи между европейцами и восстановить картину относительно недавних миграций, исследователи Peter Ralph и Graham Coop проанализировали данные секвенирования геномов 2257 человек, живущих по всему континенту. Они сравнивали длинные фрагменты геномов (гаплотипы) между собой как для отдельных индивидуумов, так и между популяциями. Если у близких родственников совпадающие участки довольно большие, со временем они становятся все короче в результате рекомбинаций, поэтому длину совпадающих фрагментов генома можно считать мерилом родства.

Согласно ожиданиям, анализ для разных стран показал, что чем ближе люди живут, тем более высокая степень родства для них характерна. Однако обнаружились и отклонения от этой закономерности: например, люди, живущие в Великобритании, разделили больше общих предков с жителями Ирландии, чем с друг с другом. Также, жители Германии показали большее родство с поляками, нежели между собой. Такое распределение может отражать объединение нескольких небольших популяций в одну в результате миграций. Наибольшая степень родства между людьми обнаружилась в северной и восточной Европе а, наоборот, максимальная степень разнообразия - на Апеннинском полуострове, в Италии.
Исследователи также попытались определить, сколько общих предков объединяет людей в современной Европе, и насколько давно они разошлись между собой. Оказалось, что для интервала в 500 лет общих предков можно предположить только для людей, которые сегодня живут в одной стране. Самыми «близкородственными» оказались албанцы (90 общих предков в интервале в 500 лет и 600 - в интервале 500-1500 лет назад). С другой стороны, практически любые два человека из любой точки Европы имеют сотни общих предков, живших более 1500 лет назад. Исключение составляют, опять же, итальянцы и жители Испании и Португалии, которые, как выяснилось, имеют меньше всего общего с другими европейскими популяциями.

Интересный вывод, который Ральф и Куп сделали по итогам анализа полногеномных данных – число общих предков, объединяющих людей из разных частей Европы, может отражать центральные события в европейской истории, сопровождающиеся значительными миграциями населения. Так, большое число общих предков, объединяющих жителей восточной Европы в период от 1000 до 2000 лет назад, скорее всего отражает серию миграций, начавшихся с пришествия гуннов в 4м веке и закончившихся в 6-10 веках с расселением славян.

Рисунок: распределение «родственников» в Великобритании в разные временные интервалы. Размер кружочков пропорционален числу «родственников».

Статья в PLOS Biology: Ralph P, Coop G (2013) The Geography of Recent Genetic Ancestry across Europe.
http://www.plosbiology.org/article/info%3A...al.pbio.1001555
Синопсис к указанной статье: http://www.plosbiology.org/article/info%3A...al.pbio.1001556

перевод
Guest, 26.06.2013 15:30
Участник онлайн! ЛМП
Постоянный участник




прочитанное сообщение сегодня, 15:03 Сообщение для модератора Сообщение для куратора темы Личное письмо Отправить е-маил
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей УРЛ ъ599 множественное цитирование
(молекула @ 25.06.2013 17:42)
Ссылка на исходное сообщение Ну, допустим, получили мы персональный геном. А кто-нибудь знает, как его интерпретировать? Не просто получить список аннотированных СНП с предрасположенностью. Не просто список ЦНВ и пр. А риски и прогнозы. И понимание того, имеют ли клиническое значение те или иные изменения в геноме, которые не встречались нигде ранее.


А вот этим в мире занимается всего несколько компаний, в том числе знаю 1-ну группу в России. Их софты позволяют получить из этого массива данных конкретный протокол для врачей. По-хрошему с этими компаниями производители секвенаторов обычно подписывают договор и конечный пользователь получает такой софт за дополнительную плату + за 5-10К$ ежегодное обновление. У Лайф-тека таких договоренностей по-моему еще нет (давно не смотрел).

даша - тут вроде ясно обяснили
vrida2, 17.09.2021 00:51
audiobookkeeper.rucottagenet.rueyesvision.rueyesvisions.comfactoringfee.ru
filmzones.rugadwall.rugaffertape.rugageboard.rugagrule.ru
gallduct.rugalvanometric.rugangforeman.rugangwayplatform.rugarbagechute.ru
gardeningleave.rugascautery.rugashbucket.rugasreturn.rugatedsweep.ru
gaugemodel.rugaussianfilter.rugearpitchdiameter.rugeartreating.rugeneralizedanalysis.ru
generalprovisions.rugeophysicalprobe.rugeriatricnurse.rugetintoaflap.rugetthebounce.ru
habeascorpus.ruhabituate.ruhackedbolt.ruhackworker.ruhadronicannihilation.ru
haemagglutinin.ruhailsquall.ruhairysphere.ruhalforderfringe.ruhalfsiblings.ru
hallofresidence.ruhaltstate.ruhandcoding.ruhandportedhead.ruhandradar.ru
handsfreetelephone.ruhangonpart.ruhaphazardwinding.ruhardalloyteeth.ruhardasiron.ru
hardenedconcrete.ruharmonicinteraction.ruhartlaubgoose.ruhatchholddown.ruhaveafinetime.ru
hazardousatmosphere.ruheadregulator.ruheartofgold.ruheatageingresistance.ruheatinggas.ru
heavydutymetalcutting.rujacketedwall.rujapanesecedar.rujibtypecrane.rujobabandonment.ru
jobstress.rujogformation.rujointcapsule.rujointsealingmaterial.rujournallubricator.ru
juicecatcher.rujunctionofchannels.rujusticiablehomicide.rujuxtapositiontwin.rukaposidisease.ru
keepagoodoffing.rukeepsmthinhand.rukentishglory.rukerbweight.rukerrrotation.ru
keymanassurance.rukeyserum.rukickplate.rukillthefattedcalf.rukilowattsecond.ru
kingweakfish.rukinozones.rukleinbottle.rukneejoint.ruknifesethouse.ru
knockonatom.ruknowledgestate.rukondoferromagnet.rulabeledgraph.rulaborracket.ru
labourearnings.rulabourleasing.rulaburnumtree.rulacingcourse.rulacrimalpoint.ru
lactogenicfactor.rulacunarycoefficient.ruladletreatediron.rulaggingload.rulaissezaller.ru
lambdatransition.rulaminatedmaterial.rulammasshoot.rulamphouse.rulancecorporal.ru
lancingdie.rulandingdoor.rulandmarksensor.rulandreform.rulanduseratio.ru
languagelaboratory.rulargeheart.rulasercalibration.rulaserlens.rulaserpulse.ru
laterevent.rulatrinesergeant.rulayabout.ruleadcoating.ruleadingfirm.ru
learningcurve.ruleaveword.rumachinesensible.rumagneticequator.rumagnetotelluricfield.ru
mailinghouse.rumajorconcern.rumammasdarling.rumanagerialstaff.rumanipulatinghand.ru
manualchoke.rumedinfobooks.rump3lists.runameresolution.runaphtheneseries.ru
narrowmouthed.runationalcensus.runaturalfunctor.runavelseed.runeatplaster.ru
necroticcaries.runegativefibration.runeighbouringrights.ruobjectmodule.ruobservationballoon.ru
obstructivepatent.ruoceanmining.ruoctupolephonon.ruofflinesystem.ruoffsetholder.ru
olibanumresinoid.ruonesticket.rupackedspheres.rupagingterminal.rupalatinebones.ru
palmberry.rupapercoating.ruparaconvexgroup.ruparasolmonoplane.ruparkingbrake.ru
partfamily.rupartialmajorant.ruquadrupleworm.ruqualitybooster.ruquasimoney.ru
quenchedspark.ruquodrecuperet.rurabbetledge.ruradialchaser.ruradiationestimator.ru
railwaybridge.rurandomcoloration.rurapidgrowth.rurattlesnakemaster.rureachthroughregion.ru
readingmagnifier.rurearchain.rurecessioncone.rurecordedassignment.rurectifiersubstation.ru
redemptionvalue.rureducingflange.rureferenceantigen.ruregeneratedprotein.rureinvestmentplan.ru
safedrilling.rusagprofile.rusalestypelease.rusamplinginterval.rusatellitehydrology.ru
scarcecommodity.ruscrapermat.ruscrewingunit.ruseawaterpump.rusecondaryblock.ru
secularclergy.ruseismicefficiency.ruselectivediffuser.rusemiasphalticflux.rusemifinishmachining.ru
spicetrade.ruspysale.rustungun.rutacticaldiameter.rutailstockcenter.ru
tamecurve.rutapecorrection.rutappingchuck.rutaskreasoning.rutechnicalgrade.ru
telangiectaticlipoma.rutelescopicdamper.rutemperateclimate.rutemperedmeasure.rutenementbuilding.ru
tuchkasultramaficrock.ruultraviolettesting.ru
champak12, 16.11.2021 15:38
I am really happy to say it’s an interesting post to read .비아그라 구매
jad12, 17.12.2021 11:01
Great lineup. We will be linking to this great article on our site. Keep up the good writing.라이브카지노
vrida2, 14.01.2022 16:06
инфоинфоинфоинфоинфо
инфоинфоинфоинфоинфо
инфоинфоинфоинфоинфо
инфоинфоинфоинфоинфо
инфоинфоинфоинфоинфо
инфоинфоинфоинфоинфо
инфоинфоинфоинфоинфо
инфоинфоинфоинфоинфо
инфоинфоинфоинфоинфо
инфоинфоинфоинфоинфо
инфоинфоинфоинфоинфо
инфоинфоинфоинфоинфо
инфоинфоинфоинфоинфо
инфоинфоинфоинфоинфо
инфоинфоинфоинфоинфо
инфоинфоинфоинфоинфо
инфоинфоинфоинфоинфо
инфоинйоинфоинфоинфо
инфоинфоинфоинфоинфо
инфоинфоинфоинфоинфо
инфоинфоинфоинфоинфо
инфоинфоинфоинфоинфо
инфоинфоинфоинфоинфо
инфоинфоинфоинфоинфо
инфоинфоинфоинфоинфо
инфоинфоинфоинфоинфо
инфоинфоинфоинфоинфо
инфоинфоинфоинфоинфо
инфоинфоинфоинфоинфо
инфоинфоинфоинфоинфо
инфоинфоинфоинфоинфо
инфоинфоинфоинфоинфо
инфоинфоинфоинфоинфо
инфоинфоинфоинфоинфо
инфоинфоинфоинфоинфо
инфоинфоинфоинфоинфо
инфоинфоинфоинфоинфо
инфоинфоинфоинфоинфо
инфоинфоинфоинфоинфо
инфоинфоинфоинфоинфо
инфоинфоинфоинфоинфо
инфоинфоинфоинфоинфо
инфоинфоинфоинфоинфо
инфоинфоинфоинфоинфо
tuchkasинфоинфо
vrida2, 25.06.2022 19:28
сайтсайтсайтсайтсайт
сайтсайтсайтсайтсайт
сайтсайтсайтсайтсайт
сайтсайтсайтсайтсайт
сайтсайтсайтсайтсайт
сайтсайтсайтсайтсайт
сайтсайтсайтсайтсайт
сайтсайтсайтсайтсайт
сайтсайтсайтсайтсайт
сайтсайтсайтсайтсайт
сайтсайтсайтсайтсайт
сайтсайтсайтсайтсайт
сайтсайтсайтсайтсайт
сайтсайтсайтсайтсайт
сайтсайтсайтсайтсайт
сайтсайтсайтсайтсайт
сайтсайтсайтсайтсайт
сайтсайтсайтсайтсайт
сайтсайтсайтсайтсайт
сайтсайтсайтсайтсайт
сайтсайтсайтсайтсайт
сайтсайтсайтсайтсайт
сайтсайтинфосайтсайт
сайтсайтсайтсайтсайт
сайтсайтсайтсайтсайт
сайтсайтсайтсайтсайт
сайтсайтсайтсайтсайт
сайтсайтсайтсайтсайт
сайтсайтсайтсайтсайт
сайтсайтсайтсайтсайт
сайтсайтсайтсайтсайт
сайтсайтсайтсайтсайт
сайтсайтсайтсайтсайт
сайтсайтсайтсайтсайт
сайтсайтсайтсайтсайт
сайтсайтсайтсайтсайт
сайтсайтсайтсайтсайт
сайтсайтсайтсайтсайт
сайтсайтсайтсайтсайт
сайтсайтсайтсайтсайт
сайтсайтсайтсайтсайт
сайтсайтсайтсайтсайт
сайтсайтсайтсайтсайт
сайтсайтсайтсайтсайт
tuchkasсайтсайт
vrida2, 23.11.2022 02:16
audiobookkeepercottageneteyesvisioneyesvisionsfactoringfee
filmzonesgadwallgaffertapegageboardgagrule
gallductgalvanometricgangforemangangwayplatformgarbagechute
gardeningleavegascauterygashbucketgasreturngatedsweep
gaugemodelgaussianfiltergearpitchdiametergeartreatinggeneralizedanalysis
generalprovisionsgeophysicalprobegeriatricnursegetintoaflapgetthebounce
habeascorpushabituatehackedbolthackworkerhadronicannihilation
haemagglutininhailsquallhairyspherehalforderfringehalfsiblings
hallofresidencehaltstatehandcodinghandportedheadhandradar
handsfreetelephonehangonparthaphazardwindinghardalloyteethhardasiron
hardenedconcreteharmonicinteractionhartlaubgoosehatchholddownhaveafinetime
hazardousatmosphereheadregulatorheartofgoldheatageingresistanceheatinggas
heavydutymetalcuttingjacketedwalljapanesecedarjibtypecranejobabandonment
jobstressjogformationjointcapsulejointsealingmaterialjournallubricator
juicecatcherjunctionofchannelsjusticiablehomicidejuxtapositiontwinkaposidisease
keepagoodoffingkeepsmthinhandkentishglorykerbweightkerrrotation
keymanassurancekeyserumkickplatekillthefattedcalfkilowattsecond
kingweakfishkinozoneskleinbottlekneejointknifesethouse
knockonatomknowledgestatekondoferromagnetlabeledgraphlaborracket
labourearningslabourleasinglaburnumtreelacingcourselacrimalpoint
lactogenicfactorlacunarycoefficientladletreatedironlaggingloadlaissezaller
lambdatransitionlaminatedmateriallammasshootlamphouselancecorporal
lancingdielandingdoorlandmarksensorlandreformlanduseratio
languagelaboratorylargeheartlasercalibrationlaserlenslaserpulse
latereventlatrinesergeantlayaboutleadcoatingleadingfirm
learningcurveleavewordmachinesensiblemagneticequatormagnetotelluricfield
mailinghousemajorconcernmammasdarlingmanagerialstaffmanipulatinghand
manualchokemedinfobooksmp3listsnameresolutionnaphtheneseries
narrowmouthednationalcensusnaturalfunctornavelseedneatplaster
necroticcariesnegativefibrationneighbouringrightsobjectmoduleobservationballoon
obstructivepatentoceanminingoctupolephononofflinesystemoffsetholder
olibanumresinoidonesticketpackedspherespagingterminalpalatinebones
palmberrypapercoatingparaconvexgroupparasolmonoplaneparkingbrake
partfamilypartialmajorantquadruplewormqualityboosterquasimoney
quenchedsparkquodrecuperetrabbetledgeradialchaserradiationestimator
railwaybridgerandomcolorationrapidgrowthrattlesnakemasterreachthroughregion
readingmagnifierrearchainrecessionconerecordedassignmentrectifiersubstation
redemptionvaluereducingflangereferenceantigenregeneratedproteinreinvestmentplan
safedrillingsagprofilesalestypeleasesamplingintervalsatellitehydrology
scarcecommodityscrapermatscrewingunitseawaterpumpsecondaryblock
secularclergyseismicefficiencyselectivediffusersemiasphalticfluxsemifinishmachining
spicetradespysalestunguntacticaldiametertailstockcenter
tamecurvetapecorrectiontappingchucktaskreasoningtechnicalgrade
telangiectaticlipomatelescopicdampertemperateclimatetemperedmeasuretenementbuilding
tuchkasultramaficrockultraviolettesting
Это — лёгкая версия форума. Чтобы попасть на полную, щелкните здесь.
Invision Power Board © 2001-2024 Invision Power Services, Inc.