Полная версия страницы  English  

Unifrac анализ в QIIME

sunword, 14.04.2016 06:43
Как мы знаем, онлайн Unifrac снесли и теперь его нет. Как я понял, он теперь входит в QIIME. (Если кто не знает как установить систему, вот ссылка (там и видеопояснялка есть) http://qiime.org/1.9.0/install/virtual_box.html. Сам Unifrac теперь называется как beta_diversity.py
Но вот вопрос, какие команды использовать для анализа. Какие файлы должны содержаться чтобы построить графики в трёх координатах PCoA? Нашёл статью, но не понятны команды... Вот http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/20383131 Есть разбирающиеся люди?
Это — лёгкая версия форума. Чтобы попасть на полную, щелкните здесь.
Invision Power Board © 2001-2024 Invision Power Services, Inc.