Полная версия страницы  English  

Уникальная α-галактозидаза из архей

daniil naumoff, 21.03.2006 18:46
Fig3.jpg - кликните, чтобы открыть увеличенную картинкуГликозидазы α-галактозидазы [К.Ф. 3.2.1.22] - широко распространённая группа ферментов. Они представленны почти у весх эукариот, у многих бактерий и почти отсутствуют у архей. Экстремальные (температура, pH, йонная сила) экологические ниши, в которых живут большинство архей обычно не содержат существенного количества углеводов. Как результат, геномы архей как правило очень обеднены (или вовсе лишены) генами, кодирующими гликозидазы. Большинство известных α-галактозидаз на основе гомологии отнесены к одному из двух семейств - GH27 или GH36, которые находятся в отдалённом родстве. В составе этих двух семейств белков археи в настоящее время представленны лишь гипотетическим белком (ORF) из двух видов рода Sulfolobus.

В рассматриваемой работе авторы исследовали уникального представителя семейства GH36 архейного происхождения. Изучался фермент как из Sulfolobus solfataricus, так и из Sulfolobus tokodaii. Показано, что белок является типичной α-галактозидазой, расщепляющей pNPG (para-nitrophenol-α-D-galactopyranoside). Из синтетических субстратов также проявляет активность на pNP-β-L-arabinopyranoside, но очень высокая Km позволяет предполагать, что эта активность не имеет биологического значения. Из природных субстратов фермент способен расщеплять α-галактозиды: мелибиозу (2.6 U/mg), раффинозу (2.9 U/mg) и стахиозу (1.2 U/mg). Исследован ряд биохимических свойств фермента. Обсуждается филогения α-галактозидаз семейств GH27 и GH36, а также возможное строение их активного центра.

Результаты работы указывают на вероятный горизонтальный перенос α-галактозидазного гена в археи рода Sulfolobus, в пределах которого он представлен не у всех видов. Происхождение этого гена определить пока не представляется возможным. Однако, исходя из топологии филогенетического древа нельзя исключать и альтернативную возможность: Sulfolobus может быть уникальным организмом, сохранившим α-галактозидазный ген, утраченный остальными археями. Наиболее близкие биохимически охарактеризованные гомологи этого белка - α-галактозидазы и α-галактозил-трансферазы цветковых растений.

По материалам статьи: Stan J. J. Brouns, Nicole Smits, Hao Wu, Ambrosius P. L. Snijders, Phillip C. Wright, Willem M. de Vos, and John van der Oost. Identification of a Novel α-Galactosidase from the Hyperthermophilic Archaeon Sulfolobus solfataricus. J. Bacteriol. 2006;188 2392-2399. Абстракт

категория - 2
daniil naumoff, 22.03.2006 15:59
Филогенетическая часть этой работы в основном дублирует ранее полученные нами данные. Если кого заинтересует, работы можно скачать:

1. Наумов Д.Г. Филогенетический анализ α-галактозидаз семейства GH27. Молекулярная биология. 2004, т. 38, №3, стр. 463-476. Abstract PDF

2. D.G. Naumoff. 2004. The α-galactosidase superfamily: sequence based classification of α-galactosidases and related glycosidases. Proceedings of The Fourth International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure. July 25-30, 2004. Novosibirsk. Russia. V.1. P.315-318. PDF
bov12, 02.08.2021 12:29
Pretty good post. I have just stumbled upon your blog and enjoyed reading your blog posts very much. I am looking for new posts to get more precious info. Big thanks for the useful info.토토사이트 jump.gif
bov12, 13.08.2021 18:31
Pretty good post. I have just stumbled upon your blog and enjoyed reading your blog posts very much. I am looking for new posts to get more precious info. Big thanks for the useful info.사설카지노
nigoal123, 28.04.2022 11:49
An article is written บาคาร่าออนไลน์ on a particular theme slot xo in a style that makes 11hilo it suitable for publication สล็อต in an English-language 123GOAL newspaper, magazine

Always read the nigoal instructions for. ลิงค์รับทรัพย์ the task carefully พ ริ ต ตี้ เกม มิ่ง to be clear about ราคาฟุตบอล on things, so most Hotgraph whom you are writing for.
nigoal123, 29.04.2022 10:43
Article writing is a บาคาร่าออนไลน์ staple for every business slot xo seeking to stand out great 11hilo process until completion. สล็อต writer to be successful. 123GOAL from the crowd.

That’s why you need nigoal high-quality articles to ลิงค์รับทรัพย์ showcase your expertise พ ริ ต ตี้ เกม มิ่ง fuel your social media ราคาฟุตบอล and contribute to Hotgraph your SEO rankings.
nigoal123, 29.04.2022 10:52
Article writing is a บาคาร่าออนไลน์ staple for every business slot xo seeking to stand out great 11hilo process until completion. สล็อต writer to be successful. 123GOAL from the crowd.

That’s why you need nigoal high-quality articles to ลิงค์รับทรัพย์ showcase your expertise พ ริ ต ตี้ เกม มิ่ง fuel your social media ราคาฟุตบอล and contribute to Hotgraph your SEO rankings.
nigoal123, 30.04.2022 11:20
You need an idea บาคาร่าออนไลน์ something you want to share slot xo together an outline to show us 11hilo that your idea is likely สล็อต to be of interest to our readers. 123GOAL From that point on

we can give you any help nigoal that you need as you write ลิงค์รับทรัพย์ and revise your article. พ ริ ต ตี้ เกม มิ่ง Experienced writers all ราคาฟุตบอล started somewhere Hotgraph your writing career with us.
nigoal123, 02.05.2022 11:39
Then write a rough Nigoalrough draft including everything Nigoal123 Slotyou can think of. เครดิตฟรี Stay loose ราคาบอล avoid getting analytical บาคาร่าand enjoy the process of สล็อตออนไลน์ and enjoy the process Kingmaker of sharing what you know. Sexy gaming When you’re done SA gaming Then put it aside for a while. Dream Gaming
nigoal123, 04.05.2022 09:46
Along with a title that บาคาร่าออนไลน์ attention and indicates slot xo a well-written abstract is essential. 11hilo The abstract is what readers สล็อต and other researchers will 123GOAL look at first to determine

if your article is worth reading. nigoal It is worth spending time ลิงค์รับทรัพย์ on a succinct พ ริ ต ตี้ เกม มิ่ง and relevant abstract that ราคา บอล will clarify exactly what you Hotgraph are arguing or proposing.
vrida2, 25.07.2022 01:08
инфоинфоинфоинфоинфо
инфоинфоинфоинфоинфо
инфоинфоинфоинфоинфо
инфоинфоинфоинфоинфо
инфоинфоинфоинфоинфо
инфоинфоинфоинфоинфо
инфоинфоинфоинфоинфо
инфоинфоинфоинфоинфо
инфоинфоинфоинфоинфо
инфоинфоинфоинфоинфо
инфоинфоинфоинфоинфо
инфоинфоинфоинфоинфо
инфоинфоинфоинфоинфо
инфоинфоинфоинфоинфо
инфоинфоинфоинфоинфо
инфоинфоинфоинфоинфо
инфоинфоинфоинфоинфо
инфоинйоинфоинфоинфо
инфоинфоинфоинфоинфо
инфоинфоинфоинфоинфо
инфоинфоинфоинфоинфо
инфоинфоинфоинфоинфо
инфоинфоlandmarksensorинфоинфо
инфоинфоинфоинфоинфо
инфоинфоинфоинфоинфо
инфоинфоинфоинфоинфо
инфоинфоинфоинфоинфо
инфоинфоинфоинфоинфо
инфоинфоинфоинфоинфо
инфоинфоинфоинфоинфо
инфоинфоинфоинфоинфо
инфоинфоинфоинфоинфо
инфоинфоинфоинфоинфо
инфоинфоинфоинфоинфо
инфоинфоинфоинфоинфо
инфоинфоинфоинфоинфо
инфоинфоинфоинфоинфо
инфоинфоинфоинфоинфо
инфоинфоинфоинфоинфо
инфоинфоинфоинфоинфо
инфоинфоинфоинфоинфо
инфоинфоинфоинфоинфо
инфоинфоинфоинфоинфо
инфоинфоинфоинфоинфо
tuchkasинфоинфо
baccaratsite, 15.12.2022 05:57
From some point on, I am preparing to build my site while browsing various sites. It is now somewhat completed. If you are interested, please come to play with baccaratsitebaccaratsite !!
vrida2, 20.12.2022 16:26
audiobookkeeper.rucottagenet.rueyesvision.rueyesvisions.comfactoringfee.ru
filmzones.rugadwall.rugaffertape.rugageboard.rugagrule.ru
gallduct.rugalvanometric.rugangforeman.rugangwayplatform.rugarbagechute.ru
gardeningleave.rugascautery.rugashbucket.rugasreturn.rugatedsweep.ru
gaugemodel.rugaussianfilter.rugearpitchdiameter.rugeartreating.rugeneralizedanalysis.ru
generalprovisions.rugeophysicalprobe.rugeriatricnurse.rugetintoaflap.rugetthebounce.ru
habeascorpus.ruhabituate.ruhackedbolt.ruhackworker.ruhadronicannihilation.ru
haemagglutinin.ruhailsquall.ruhairysphere.ruhalforderfringe.ruhalfsiblings.ru
hallofresidence.ruhaltstate.ruhandcoding.ruhandportedhead.ruhandradar.ru
handsfreetelephone.ruhangonpart.ruhaphazardwinding.ruhardalloyteeth.ruhardasiron.ru
hardenedconcrete.ruharmonicinteraction.ruhartlaubgoose.ruhatchholddown.ruhaveafinetime.ru
hazardousatmosphere.ruheadregulator.ruheartofgold.ruheatageingresistance.ruheatinggas.ru
heavydutymetalcutting.rujacketedwall.rujapanesecedar.rujibtypecrane.rujobabandonment.ru
jobstress.rujogformation.rujointcapsule.rujointsealingmaterial.rujournallubricator.ru
juicecatcher.rujunctionofchannels.rujusticiablehomicide.rujuxtapositiontwin.rukaposidisease.ru
keepagoodoffing.rukeepsmthinhand.rukentishglory.rukerbweight.rukerrrotation.ru
keymanassurance.rukeyserum.rukickplate.rukillthefattedcalf.rukilowattsecond.ru
kingweakfish.rukinozones.rukleinbottle.rukneejoint.ruknifesethouse.ru
knockonatom.ruknowledgestate.rukondoferromagnet.rulabeledgraph.rulaborracket.ru
labourearnings.rulabourleasing.rulaburnumtree.rulacingcourse.rulacrimalpoint.ru
lactogenicfactor.rulacunarycoefficient.ruladletreatediron.rulaggingload.rulaissezaller.ru
lambdatransition.rulaminatedmaterial.rulammasshoot.rulamphouse.rulancecorporal.ru
lancingdie.rulandingdoor.rulandmarksensor.rulandreform.rulanduseratio.ru
languagelaboratory.rulargeheart.rulasercalibration.rulaserlens.rulaserpulse.ru
laterevent.rulatrinesergeant.rulayabout.ruleadcoating.ruleadingfirm.ru
learningcurve.ruleaveword.rumachinesensible.rumagneticequator.rumagnetotelluricfield.ru
mailinghouse.rumajorconcern.rumammasdarling.rumanagerialstaff.rumanipulatinghand.ru
manualchoke.rumedinfobooks.rump3lists.runameresolution.runaphtheneseries.ru
narrowmouthed.runationalcensus.runaturalfunctor.runavelseed.runeatplaster.ru
necroticcaries.runegativefibration.runeighbouringrights.ruobjectmodule.ruobservationballoon.ru
obstructivepatent.ruoceanmining.ruoctupolephonon.ruofflinesystem.ruoffsetholder.ru
olibanumresinoid.ruonesticket.rupackedspheres.rupagingterminal.rupalatinebones.ru
palmberry.rupapercoating.ruparaconvexgroup.ruparasolmonoplane.ruparkingbrake.ru
partfamily.rupartialmajorant.ruquadrupleworm.ruqualitybooster.ruquasimoney.ru
quenchedspark.ruquodrecuperet.rurabbetledge.ruradialchaser.ruradiationestimator.ru
railwaybridge.rurandomcoloration.rurapidgrowth.rurattlesnakemaster.rureachthroughregion.ru
readingmagnifier.rurearchain.rurecessioncone.rurecordedassignment.rurectifiersubstation.ru
redemptionvalue.rureducingflange.rureferenceantigen.ruregeneratedprotein.rureinvestmentplan.ru
safedrilling.rusagprofile.rusalestypelease.rusamplinginterval.rusatellitehydrology.ru
scarcecommodity.ruscrapermat.ruscrewingunit.ruseawaterpump.rusecondaryblock.ru
secularclergy.ruseismicefficiency.ruselectivediffuser.rusemiasphalticflux.rusemifinishmachining.ru
spicetrade.ruspysale.rustungun.rutacticaldiameter.rutailstockcenter.ru
tamecurve.rutapecorrection.rutappingchuck.rutaskreasoning.rutechnicalgrade.ru
telangiectaticlipoma.rutelescopicdamper.rutemperateclimate.rutemperedmeasure.rutenementbuilding.ru
tuchkasultramaficrock.ruultraviolettesting.ru
Это — лёгкая версия форума. Чтобы попасть на полную, щелкните здесь.
Invision Power Board © 2001-2024 Invision Power Services, Inc.