Группой ученых из Америки и Польши была проведена оценка мощности элиминирующего отбора в отношении разного типа точковых мутаций в геноме человека. Для этого ими было проведено сопоставление двух баз данных. Первая из них оценивает потенциальную частоту мутаций различных типов (нонсенс мутации, радикальные и консервативные мисенс мутации, мутации сплайсинга, мутации в стоп кодонах с удлинением открытой рамки считывания) на основании данных о размере кодирующей области генома человека, частоте использования различных кодонов и скорости мутационного процесса в псевдогенах. Данные по оценке частоты мутаций разных типов в геноме человека были сопоставлены с данными по частоте встречаемости этих типов мутаций в базе данных по однонуклеотидным полиморфным сайтам в геноме человека (NCBI dbSNP). При этом авторы предполагают, что вероятность фиксации то или иной мутации в геноме человека в виде нормального полиморфизма зависит от мощности элиминирующего отбора против этой мутации - чем больше в базе данных dbSNP полиморфизмов того или иного типа, тем слабее идет отбор в их отношении. В качестве референсной точки были взяты нонсенс мутации - для них эффективность элиминирующего отбора была принята авторами за единицу. В этой системе координат наиболее эффективно отбор идет против мутаций сплайсинга (48% от отбора против нонсенс мутаций). Далее по порядку занятых мест расположились: мутации с удлинением открытой рамки считывания -21%, миссенс мутации -12% (причем в отношении радикальных аминокислотных миссенс мутаций отбор был в два раза более эффективен, чем в отношении консервативных замен) и молчащие замены – 3%. Особенно интересен тот факт, что даже молчащие замены не остаются не замеченными отбором. Была также сделана попытка перевести эти относительные коэффициенты мощности отбора в абсолютные на основании данных по частоте мутаций в геноме человека или частоте мутаций с потерей функций у нематоды и дрожжей.
http://hmg.oxfordjournals.org/cgi/content/abstract/15/7/1143
категория - 2