Используя плосого червя (планария), известного по своей феноменальной способности регенирировать ткани, исследователи из University of Utah School of Medicine обнаружили новый ген, который контролирует способность стволовых клеток дифференцироваться в специализированные клетки при восстановлении ткани. Ген кодирует белок семейства Argonaute/PIWI, члены которого являются важными регуляторами стволовых клеток в герминальных тканях в самых разных организмах, от растений до человека. Данное исследования опубликованы в журнале Science (Nov. 25, 2005). Интересно, что белки данного семейства также являются важнейшими компонентами системы РНК-интерференции (РНКи, механизма подавления экспрессии генов с помощью коротких РНК). Это поднимает вопрос, что участие данного белка в регенерации может происходить при участии РНКи, хотя данное предположение требует проверки. По сообщению с портала www.biologynews.net

Исследователи из Albert Einstein College of Medicine и German Cancer Research Institute обнаружили механизм, контролирующий трансляцию белка актина в определенном участке клетки. Такой механизм необходим, например, для направленного движения клеток при росте нервов и метастазах. Исследование было проведено на фибробластах, в которых полимеразация актина происходит в филаментах и вызывает образование выпячиваний, что позволяет клеткам двигаться.
Раннее этими же учеными было показано, что только что сформированная мРНК актина привлекается из ядра к растущему концу фибробласта белком, названным ZBP1. В настоящем исследовании была продемонстрированна другая важная роль ZBP1 - комплекс мРНК/ZBP1 на перефирии клетки атакуется белком Src, который фосфорилирует ZBP1. Фосфорилирование происходит вблизи сайта связывания ZBP1 с мРНК и приводит к ее высвобождению. Это позволяет данной мРНК локально транслироваться.
Исследование опубликовано в последнем номере журнала Nature (Nov. 24, 2005). По сообщению с портала www.biologynews.net

---

Поблагодарили (4): Дядя ФАКСер, Miakarolianich, bukach, ivank

Химики-теоретики из Duke University, изучающие квантовые механизмы перемещения электронов между биологическими молекулами, обнаружили,что вода может иметь значительную роль в таком перемещении.
Группа под руководством David Beratan обнаружила, что даже небольшое количество воды, помещенное между двумя взаимодействующими белками ("docking proteins") создает неожиданно подходящие условия для туннелирования электронов от одного белка к другому. По всей видимости, это возможно благодаря тому, что молекулы воды под влиянием молекул белков могут формировать упорядоченные кластеры. Такие кластеры на промежуточных расстояниях и являются посредникам в передаче электронов. Это исследование было опубликовано в последнем номере журнала Science (Nov. 25, 2005).
По сообщения с портала www.physorg.com/news8476.htm

---

Поблагодарили (4): Esya, polar, Дядя ФАКСер, ivank

В разделе "Расчёты" появилась новая программа: Предсказание нуклеотидной последовательности по аминокислотной.

Она строит нуклеотидную последовательность по белковой. При этом учитывается частота встречаемости кодонов в лабораторных организмах: Homo sapiens, Mus musculus, Drosophila melanogaster, Arabidopsis thaliana, Saccharomyces cerevisiae, Pichia pastoris, Escherichia coli.

Результат выводится в трёх видах:
(1) в столбик с указанием вероятности присутствия определённого нуклеотида;
(2) в строку: верхний ряд - наиболее вероятная последовательность (чем ниже, тем менее вероятная).
(3) в строку с использованием однобуквенной полиморфной записи.

Программа понимает трёхбуквенный и однобуквенный код, умеет выводить последовательность в разных регистрах и ДНК/РНК виде.

Желаю всем приятного использования!

Чуть переделана программа "Расчёт параметров PCR". Добавлена возможность задавать количество матрицы весом геномной дНК ряда организмов. Заодно программой можно пользоваться для расчета количества копий гена в данном количестве геномной ДНК.

Обновлены таблицы частоты кодонов для программы "Поиск редких кодонов в кодирующей последовательности" и статьи "Частота встречаемости кодонов в различных организмах". Заодно сделана таблица "Преобразование белковой последовательности в нуклеотидную для разных организмов"

Подготовлен протокол: 'Микро'клонирование ПЦР-продуктов в TOPO-системе Invitrogen. Описывается способ экономного использования кита. Вместо десятков тысяч клонов получаются сотни, но ведь большего и не надо

Приятного использования!

Подготовлено ещё четыре давно обещанных протокола:

• Очистка олигонуклеотидов из полиакриламидного геля
• Очистка геномной ДНК из растений на силика-колонке
• Очистка геномной ДНК из слюны на силика-колонке
• Приготовление hot-start Taq полимеразы

Всем приятной работы!

Выложены давно обещанные "методики" изготовления форезных камер:

Вертикальная миникамера для электрофореза -- с чертежами гребенок;

Камера для горизонтального электрофореза -- с чертежами плашек и гребенок.

Всем приятного использования!

Выставка живых насекомых и других членистоногих

12 октября этого года (среда) пройдет очередная выставка живых насекомых и других членистоногих на кафедре энтомологии биологического факультета МГУ. Кроме инсектариев планируется экспозиция рисунков и фотографий насекомых. Приглашаются все желающие.
Время работы с 14 до 17:30

P.S. Те желающие, кто не имеет отношения к МГУ - присылайте свои реальные ФИО в ЛС Bolivar'у или на мэйл Александру (entomology@rambler.ru), чтобы составить списки для охраны, которая иначе Вас не пропустит.

Entomology Info

---

Поблагодарили (2): Helene, ell

Одного студента на первый день практики попросили приготовить литр одномолярной уксусной кислоты выдали ему литровую мерную колбу и указали направление на шкаф с банками. Там он нашел заветную бутылку с этикеткой.

Сколько миллилитров (с точностью до одного знака после запятой) он должен отмерить и перенести в колбу?

Ответ :   

---

      

/ Сборник задач,  #44886  /

Первые решившие: Lil, Tony, Andruxa, Sergeant, musand, Erin, Nuken, Qzak, agrish, Wolf

Область: Другая химия

Характер и уровень: Простые (расч), Простые (опред)

---

С удовольствием представляю текст "Эксперименты на животных и гуманизм" выполненный в стиле брошюр "это должен знать каждый".

Представляю "с удовольствием" сразу по двум причинам: (i) во-первых, текст удался и по размеру и по стилю (мои поздравления авторам); (ii) во-вторых, черезвычайно приятно, что нашлись люди, которые не пожалели времени и сил на благое дело.

Проблема вот в чём. Существует некая секта "Фронт освобождения животных", которая занимается хулиганством, и подводит под это занятие псевдогуманистическую базу. Вполне вероятно, что кто-то принимает рассуждения организаторов секты всерьёз и с чистым сердцем идёт на подвиг. А кто-то этим героям сочувствует. Как на заре христианства - ничего, кроме разъяснительной работы против варварства не поможет. Я пишу вполне серьёзно - милиция может справиться с хулиганами, но к работе с фанатиками она мало приспособлена.

Ребята пытались разъяснять в гостевой книге "Фронта освобождения", но там их постинги удалялись быстрее, чем появлялись.

Резюме. Моё почтение авторам, ко всем остальным просьба - распространять просвещение по мере возможности. Ещё одна просьба: проводится сбор подписей, чтобы текст был более убедительным (в комментариях к этой новости - фамилия, имя и почтовый адрес). Я подписался, присоединяйтесь.

Ниже - оглавление.

---

Почему людям необходимы биомедицинские исследования

Существует ли альтернатива экспериментам с лабораторными животными?
Правила проведения экспериментов строго требуют от исследователя исключения ненужных страданий животных
Существует большое количество примеров действительно неоправданно жестокого обращения с животными
Почему бессмысленны действия освободителей животных
Человечество не может отказаться от своего биологического права использовать или убивать животных

Авторы позиции и ученые-исследователи, поддерживающие её основные положения

Обсуждение

Интернет проект "Клеточные технологии в медицине"
http://www.celltranspl.ru

Аудитория:
Цель:

Добро пожаловать!

Новый интернет-проект "Стволовые клетки - мнения без имён" Cells-NoName.Ru

На страницах сайта - масса ссылок на презентации, full text'ы, обзоры компаний и банков стволовых клеток, а также фотографии ученых, сделавших открытия в области стволовых клеток, и просто шарлатанов.
Сайт обновляется несколько раз в месяц.
Посетите и оцените Cells-NoName.Ru

На сайте опубликован обзор "Птичий грипп" /Лобанова Т.П., Кихтенко Н.В.; Отдел научно-технической информации ГНЦ ВБ "Вектор", Кольцово, Новосибирской обл.
1. Общая информация

2. Характеристика птичьего гриппа у птиц
.....2.1 Резервуар и пути переноса
.....2.2. Клинические проявления и иммунитет у птиц

3. Характеристика птичьего гриппа у человека
.....3.1. Случаи заболевания птичьим гриппом среди людей
.....3.2. Эпидемиология заболевания
.....3.3. Клинические проявления, патогенез
.....3.4. Вакцины
.....3.5. Разработка средств обнаружения и диагностики
.....3.6. Лечение заболевания

4. Потенциальная опасность пандемии гриппа

5. Пандемии гриппа в человеческой популяции

В разделе "Портал" выложен обзор "Практическое введение в Real-time PCR" (автор: a11). В нём рассматривается общий принцип и разновидности real-time PCR, даны рекомендации по выбору методики и обработке результатов. Особое внимание уделяется оценке качества и отладке реакции.
Огромное спасибо автору, и пользы от чтения всем остальным!

Оглавление

Новый протокол "Определение концентрации белка (Брэдфорд; Лоури)" в разделе "Методы". Море благодарностей Андрею Шанько из Всероссийского Института Агрономической Биотехнологии (Москва)!

В разделе "Методы" появилось четыре новых протокола. Они связаны друг с другом тем, что во всех случаях используется очистка нуклеиновых кислот на самодельных silica spin колонках.
Изготовление колонок описывается в первом протоколе. У приведённых методик только одно достоинство по сравнению с фирменными - они дешевле.